1
تهران، دانشگاه تربیت مدرس، دانشکده علوم زیستی، گروه بیوشیمی
2
تهران، دانشگاه تهران، دانشکده علوم و فنون نوین، گروه مهندسی علوم زیستی
چکیده
از ابتدای قرن بیست و یکم کروناویروسها با منشا حیوانی عامل چندین اپیدمی پنومونی مرگبار در انسان بودهاند از جمله بیماری سارس، مرس و در حال حاضر بیماری کووید-19 که به صورت پاندمی در جهان شیوع پیدا کرده است. ظهور این سندرمهای حاد تنفسی بر تهدید انتقال بین گونه ایی کروناویروسها و شیوع در انسانها تاکید دارد. کروناویروسها حاوی یک پروتئین اسپایک (spike) (S) واقع در سطح هستند که به واسطه شناخت گیرنده و الحاق غشا، عفونت را آغاز می کنند و عامل کلیدی در اختصاصیت میزبان و انتفال بین گونهایی ست. تا به امروز هیچ درمان خاص یا واکسنی علیه هیچ یک از هفت کروناویروس انسانی مورد تأیید قرار نگرفته است، و این امر ضرورت بررسی اصول حاکم بر ورود ویروس و مکانیسم انتقال بین گونهای را تأکید میکند. در این مقاله مروری، مکانیسم عفونت مورد استفاده توسط کروناویروسها با تمرکز بر روی ویژگیهای پروتئین S، و اتصال به گیرنده آن، و همچنین تفاوتها در گونههای مختلف و فرآیندهای پروتئازی درگیر در آغاز عفونت بررسی گردیده تا تصویر کاملی از نقش آنها در چرخه تکثیر کروناویروسها ارائه شود و همچنین در انتها درباره روشهای درمانی مبتنی بر پروتئین S و گیرنده ACE2 صحبت می شود.
Lu R, Zhao X, Li J, et al (2020) Genomic characterisation and epidemiology of 2019 novel coronavirus: implications for virus origins and receptor binding. Lancet 395:565–574
Zhou P, Tachedjian M, Wynne JW, et al (2016) Contraction of the type i IFN locus and unusual constitutive expression of IFN-α in bats. Proc Natl Acad Sci U S A 113:2696–2701 . doi: 10.1073/pnas.1518240113
Wu A, Peng Y, Huang B, et al (2020) Genome Composition and Divergence of the Novel Coronavirus (2019-nCoV) Originating in China. Cell Host Microbe 27:325–328 . doi: 10.1016/j.chom.2020.02.001
Singhal T (2020) A Review of Coronavirus Disease-2019 (COVID-19). 87:281–286
Lai MC (2007) Coronaviridae. Fields Virol 1305–1318
Adams MJ, King AMQ, Carstens EB (2013) Ratification vote on taxonomic proposals to the International Committee on Taxonomy of Viruses (2013). Arch Virol 158:2023–2030
van Regenmortel MH V, Fauquet CM, Bishop DHL, et al (2000) Virus taxonomy: classification and nomenclature of viruses. Seventh report of the International Committee on Taxonomy of Viruses. Academic Press
Rockett R (2010) Human coronaviruses. PCR Clin Microbiol An Aust Int Perspect 273–275 . doi: 10.1007/978-90-481-9039-3_42
Andersen KG, Rambaut A, Lipkin WI, et al (2020) The proximal origin of SARS-CoV-2. Nat Med 2–4 . doi: 10.1038/s41591-020-0820-9
Wang L, Wang Y, Ye D, Liu Q (2020) A review of the 2019 Novel Coronavirus (COVID-19) based on current evidence. Int J Antimicrob Agents 105948 . doi: 10.1016/j.ijantimicag.2020.105948
Carter J, Saunders V, Saunders VA (2007) Virology: principles and applications. John Wiley & Sons
Alsaadi EAJ, Jones IM (2019) Membrane binding proteins of coronaviruses. 14:275–286
Li F (2016) Structure, Function, and Evolution of Coronavirus Spike Proteins. Annu Rev Virol 3:237–261 . doi: 10.1146/annurev-virology-110615-042301
Hoffmann M, Kleine-Weber H, Schroeder S, et al (2020) SARS-CoV-2 Cell Entry Depends on ACE2 and TMPRSS2 and Is Blocked by a Clinically Proven Protease Inhibitor. Cell 1–10 . doi: 10.1016/j.cell.2020.02.052
Masters PS (2006) The molecular biology of coronaviruses. Adv Virus Res 66:193–292
Li F (2012) Evidence for a common evolutionary origin of coronavirus spike protein receptor-binding subunits. J Virol 86:2856–2858
Peng G, Sun D, Rajashankar KR, et al (2011) Crystal structure of mouse coronavirus receptor-binding domain complexed with its murine receptor. Proc Natl Acad Sci 108:10696–10701
Schwegmann-Weßels C, Herrler G (2006) Sialic acids as receptor determinants for coronaviruses. Glycoconj J 23:51–58
Chen Y, Rajashankar KR, Yang Y, et al (2013) Crystal Structure of the Receptor-Binding Domain from Newly Emerged Middle East Respiratory Syndrome Coronavirus. J Virol 87:10777–10783 . doi: 10.1128/jvi.01756-13
Tortorici MA, Veesler D (2019) Structural insights into coronavirus entry, 1st ed. Elsevier Inc.
Millet JK, Whittaker GR (2015) Host cell proteases: Critical determinants of coronavirus tropism and pathogenesis. Virus Res 202:120–134
Wrapp D, Wang N, Corbett KS, et al (2020) Cryo-EM structure of the 2019-nCoV spike in the prefusion conformation. Science (80- ) 367:1260–1263
Zhou P, Yang X-L, Wang X-G, et al (2020) A pneumonia outbreak associated with a new coronavirus of probable bat origin. Nature 579:270–273
Ge X-Y, Li J-L, Yang X-L, et al (2013) Isolation and characterization of a bat SARS-like coronavirus that uses the ACE2 receptor. Nature 503:535–538
Li F, Li W, Farzan M, Harrison SC (2005) Structure of SARS coronavirus spike receptor-binding domain complexed with receptor. Science (80- ) 309:1864–1868
Towler P, Staker B, Prasad SG, et al (2004) ACE2 X-ray structures reveal a large hinge-bending motion important for inhibitor binding and catalysis. J Biol Chem 279:17996–18007
Lu G, Wang Q, Gao GF (2015) Bat-to-human: spike features determining ‘host jump’of coronaviruses SARS-CoV, MERS-CoV, and beyond. Trends Microbiol 23:468–478
Hou Y, Peng C, Yu M, et al (2010) Angiotensin-converting enzyme 2 (ACE2) proteins of different bat species confer variable susceptibility to SARS-CoV entry. Arch Virol 155:1563–1569
Li W, Greenough TC, Moore MJ, et al (2004) Efficient replication of severe acute respiratory syndrome coronavirus in mouse cells is limited by murine angiotensin-converting enzyme 2. J Virol 78:11429–11433
Graham RL, Baric RS (2010) Recombination, reservoirs, and the modular spike: mechanisms of coronavirus cross-species transmission. J Virol 84:3134–3146
Qu X-X, Hao P, Song X-J, et al (2005) Identification of two critical amino acid residues of the severe acute respiratory syndrome coronavirus spike protein for its variation in zoonotic tropism transition via a double substitution strategy. J Biol Chem 280:29588–29595
Reguera J, Mudgal G, Santiago C, Casasnovas JM (2014) A structural view of coronavirus–receptor interactions. Virus Res 194:3–15
Frana MF, Behnke JN, Sturman LS, Holmes K V (1985) Proteolytic cleavage of the E2 glycoprotein of murine coronavirus: host-dependent differences in proteolytic cleavage and cell fusion. J Virol 56:912–920
Shulla A, Heald-Sargent T, Subramanya G, et al (2011) A transmembrane serine protease is linked to the severe acute respiratory syndrome coronavirus receptor and activates virus entry. J Virol 85:873–882
Park JE, Li K, Barlan A, et al (2016) Proteolytic processing of middle east respiratory syndrome coronavirus spikes expands virus tropism. Proc Natl Acad Sci U S A 113:12262–12267 . doi: 10.1073/pnas.1608147113
Li H, Wu C, Yang Y, et al (2020) Furin, a potential therapeutic target for COVID-19. ChinaXiv 202002.00062 . doi: 10.12074/202002.00062
Wu C, Yang Y, Liu Y, Zhang P Furin , a potential therapeutic target for COVID-19. doi 10.12074/202002.00062
Walls AC, Tortorici MA, Snijder J, et al (2017) Tectonic conformational changes of a coronavirus spike glycoprotein promote membrane fusion. Proc Natl Acad Sci 114:11157–11162
Zhang H, Penninger JM, Li Y, et al (2020) Angiotensin-converting enzyme 2 (ACE2) as a SARS-CoV-2 receptor: molecular mechanisms and potential therapeutic target. Intensive Care Med 46:586–590 . doi: 10.1007/s00134-020-05985-9
Sui J, Li W, Murakami A, et al (2004) Potent neutralization of severe acute respiratory syndrome (SARS) coronavirus by a human mAb to S1 protein that blocks receptor association. Proc Natl Acad Sci 101:2536–2541
Yuan M, Wu NC, Zhu X, et al (2020) A highly conserved cryptic epitope in the receptor-binding domains of SARS-CoV-2 and SARS-CoV. Science 0036-8075. doi 10.1126/science.abb7269