انسانها در توالی ژنتیکی خود تقریبا یکسان هستند، اما تفاوت های اندک در DNA ما منجر به تنوع فنوتیپی فوق العاده ای در بین جمعیت بشر میشود. انواع اجتماعات میکروبی و ژنهای آنها (میکروبیوم) در بدن انسان وجود دارد که نقش اساسی در سلامتی و بیماری انسان دارند. میکروبهایی که در بدن ما ساکن هستند بسیار متغیر است ، تنها یک سوم ژنهای تشکیل دهنده آن در اکثر افراد سالم یافت می شود. چندین دهه است که روی میکروبیوم انسان تحت عنوان پروژه ی میکروبیومی انسان تحقیقاتی انجام میدهند و میکروبیوم انسان را مورد مطالعه قرار داده اند وتاثیرات میکروبیوم را روی رفتار، خلق وخو، بیماری خود ایمنی و ایمنی عصبی بررسی میکنند که اکثر این تقابل ها به میکروبیوتای روده برمیگردد. این پروژه ی میکروبیوم انسانی بزرگترین گروه و مجموعه زیست گاههای بدن را به صورت مجزا مورد مطالعات بالینی قرار میدهد. مطالعات مربوط به میکروبیوم انسان نشان میدهد که حتی افراد سالم در میکروبهایی که در زیستگاهی مانند روده، پوست، دهان و واژن وجود دارد باهم متفاوت هستند. بخش عمده ای از این تنوع هنوز ناشناخته باقی مانده است، اگرچه رژیم غذایی، محیط و ژنتیک میزبان همه در این امر دخیل هستند.
1. Turnbaugh, P.J., et al., The human microbiome project. Nature, 2007. 449(7164): p. 804-810.
Peterson, J., et al., The NIH human microbiome project. Genome research, 2009. 19(12): p. 2317-2323.
Qin, J., et al., A human gut microbial gene catalogue established by metagenomic sequencing. nature, 2010. 464(7285): p. 59-65. 4. Lederberg, J. and A.T. McCray, Ome SweetOmics--A genealogical treasury of words. The Scientist, 2001. 15(7): p. 8-8. 5. Thakur, A.K., et al., Gut-microbiota and mental health: current and future perspectives. J Pharmacol Clin Toxicol, 2014. 2(1): p. 1016. 6. Sekirov, I., et al., Gut microbiota in health and disease. Physiological reviews, 2010. 90(3): p. 859-904. 7. Ley, R.E., et al., Evolution of mammals and their gut microbes. Science, 2008. 320(5883): p. 1647-1651. 8. Martin, F.-P.J., et al., Dietary modulation of gut functional ecology studied by fecal metabonomics. Journal of proteome research, 2010. 9(10): p. 5284-5295. 9. Turnbaugh, P.J., et al., The effect of diet on the human gut microbiome: a metagenomic analysis in humanized gnotobiotic mice. Science translational medicine, 2009. 1(6): p. 6ra14-6ra14. 10. Evans, J., Modulation of the human gut microbiome in order to promote host health and well-being. 2014, Cardiff University. 11. Christian, L.M., et al., Gut microbiome composition is associated with temperament during early childhood. Brain, behavior, and immunity, 2015. 45: p. 118-127. 12. Aatsinki, A.-K., et al., Gut microbiota composition is associated with temperament traits in infants. Brain, behavior, and immunity, 2019. 80: p. 849-858. 13. Valles-Colomer, M., et al., The neuroactive potential of the human gut microbiota in quality of life and depression. Nature microbiology, 2019. 4(4): p. 623-632. 14. Polk, D.B. and R.M. Peek, Helicobacter pylori: gastric cancer and beyond. Nature reviews cancer, 2010. 10(6): p. 403-414. 15. Atherton, J.C., et al., Mosaicism in vacuolating cytotoxin alleles of Helicobacter pylori association of specific vacA types with cytotoxin production and peptic ulceration. Journal of Biological Chemistry, 1995. 270(30): p. 17771-17777. 16. Harris, P.R., et al., Role of childhood infection in the sequelae of H. pylori disease. Gut Microbes, 2013. 4(6): p. 426-438. 17. Maldonado-Contreras, A., et al., Structure of the human gastric bacterial community in relation to Helicobacter pylori status. The ISME journal, 2011. 5(4): p. 574-579. 18. Archer, N.K., et al., Staphylococcus aureus biofilms: properties, regulation, and roles in human disease. Virulence, 2011. 2(5): p. 445-459. 19. Otto, M., Staphylococcus epidermidis—the'accidental'pathogen. Nature reviews microbiology, 2009. 7(8): p. 555-567. 20. Beylot, C., et al., Propionibacterium acnes: an update on its role in the pathogenesis of acne. Journal of the European Academy of Dermatology and Venereology, 2014. 28(3): p. 271-278. 21. Fitz-Gibbon, S., et al., Propionibacterium acnes strain populations in the human skin microbiome associated with acne. Journal of investigative dermatology, 2013. 133(9): p. 2152-2160. 22. Kong, H.H., et al., Temporal shifts in the skin microbiome associated with disease flares and treatment in children with atopic dermatitis. Genome research, 2012. 22(5): p. 850-859. 23. McInnes, I.B. and G. Schett, The pathogenesis of rheumatoid arthritis. New England Journal of Medicine, 2011. 365(23): p. 2205-2219. 24. Choy, E., Understanding the dynamics: pathways involved in the pathogenesis of rheumatoid arthritis. Rheumatology, 2012. 51(suppl_5): p. v3-v11. 25. Tremlett, H., et al., The gut microbiome in human neurological disease: a review. Annals of neurology, 2017. 81(3): p. 369-382. 26. Ravel, J., et al., Vaginal microbiome of reproductive-age women. Proceedings of the National Academy of Sciences, 2011. 108(Supplement 1): p. 4680-4687. 27. Ma, B., L.J. Forney, and J. Ravel, Vaginal microbiome: rethinking health and disease. Annual review of microbiology, 2012. 66: p. 371-389. 28. Stumpf, R.M., et al., The primate vaginal microbiome: comparative context and implications for human health and disease. American journal of physical anthropology, 2013. 152: p. 119-134.
مجله زیست شناسی ایران