مجله زیست شناسی ایران

توالی یابی پیروسکانسینگ و کاربردهای آن در علوم زیستی

نویسندگان

تبریز، دانشگاه شهید مدنی آذربایجان، دانشکده کشاورزی، گروه بیوتکنولوژی کشاورزی

چکیده

تعیین توالی DNAاز مهم­ترین روش­ها جهت شناسایی ترتیب نوکلئوتید­هاست. با­توجه به پیشرفت­های چشمگیر در این زمینه، روش توالی­یابی پیروسکانسینگ (Pyrosequencing) ابداع شده است که علاوه بر تعیین توالی DNA، کاربردهای متعددی نیز دارد. استفاده از این روش در علم پزشکی و زیست فناوری بویژه در زمینه چندشکلی های تک - نوکلئوتیدی (SNP)، شناسایی میکروب­های بیماری­زا و غیربیماری­زا، متیلاسیون DNA، شناسایی جهش در ژن­های مهم درگیر در بیماری ها است. این روش، بر پایه سنتز است و سیستم آنزیمی استفاده شده در این روش شامل چهار آنزیم منحصر بفرد DNA Polymerase Klenow، ATP sulfurylase، Luciferase و Apyrase است. آزاد شدن نور حاصل از آنزیم لوسیفراز تعیین کننده نوع نوکلئوتید قرارگرفته در زنجیره DNA بوده، پیک­های مربوط به هر نوکلئوتید در پیروگرم ظاهر می­شود. آغازگر استفاده شده در این روش انعطاف­پذیر بوده، همین ویژگی منحربفرد، منجر به کارایی بالای آن شده است. عدم استفاده از مواد پرهزینه، برخلاف دیگر روش­های توالی­یابی، از مزایای دیگر این روش محسوب می­شود.
 

کلیدواژه‌ها

1- فرد ط، راد ع، ساعتیان، مینو، عارفیان. مطالعه ارتباط بین پاپیلوما ویروس انسانی  (HPV) با سرطان پستان در بیماران ایرانی. فصلنامه علوم پزشکی دانشگاه آزاد اسلامی واحد پزشکی تهران. 2013. 23(2):120-6.
2- یزدی ابراهیم. مبانی ژنتیک ملکولی(ویرایش 2). انتشارات اطلاعات. 1377. 592 صفحه.
3- یزدی صمدی بهمن و ولیزاده مصطفی. ژنتیک از دیدگاه ملکولی(ترجمه). انتشارات دانشگاه تهران. 1393. 247 صفحه.
4-Sabbaghi A, Soleimani M. An Overview of DNA Sequencing Methods (First Generation, Second Generation and Third Generation). Paramedical Sciences and Military Health. 2016;11(2):48-60.
5-Fernandez-Fernandez A, Esteller M. DNA Methylation Analysis by Bisulfite Sequencing (BS)(PROT34). The EPIGENOME Network of Excellence, Madrid, Spain. 2007.
6-Ahmadian A, Ehn M, Hober S. Pyrosequencing: history, biochemistry and future. Clinica chimica acta. 2006;363(1):83-94.
7-Langaee T, Ronaghi M. Genetic variation analyses by Pyrosequencing. Mutation Research/Fundamental and Molecular Mechanisms of Mutagenesis. 2005;573(1):96-102.
8-Cummings PJ, Ahmed R, Durocher JA, Jessen A, Vardi T, Obom KM. Pyrosequencing for microbial identification and characterization. Journ    of visualized experiments: JoVE. 2013(78).
9-Delaney C, Garg SK, Yung R. Analysis of DNA methylation by pyrosequencing. Immunosenescence: Methods and Protocols. 2015:249-64.
10-Clark SJ, Statham A, Stirzaker C, Molloy PL, Frommer M. DNA methylation: bisulphite modification and analysis. Nature protocols. 2006;1(5):2353-64.
11-Moore LD, Le T, Fan G. DNA methylation and its basic function. Neuropsychopharmacology. 2013;38(1):23.
12-Mahdieh N, Rabbani B. An overview of mutation detection methods in genetic disorders. Iranian journal of pediatrics. 2013;23(4):375.
13-Ogino S, Kawasaki T, Brahmandam M, Yan L, Cantor M, Namgyal C, et al. Sensitive sequencing method for KRAS mutation detection by Pyrosequencing. The Journal of molecular diagnostics. 2005;7(3):413-21.
14-Spittle C, Ward MR, Nathanson KL, Gimotty PA, Rappaport E, Brose MS, et al. Application of a BRAF pyrosequencing assay for mutation detection and copy number analysis in malignant melanoma. The Journal of molecular diagnostics. 2007;9(4):464-71
15-Gharizadeh B. Method development and applications of Pyrosequencing technology: Bioteknologi; 2003.
مجله زیست شناسی ایران
دوره 3، شماره 5 - شماره پیاپی 5
خرداد 1398
صفحه 56-65
  • تاریخ دریافت: 26 فروردین 1397
  • تاریخ بازنگری: 31 شهریور 1397
  • تاریخ پذیرش: 31 شهریور 1397