ژنوتیپ و فنوتیپ کووید-19: نقش آنها در بیماری زائی

نویسنده

کرمان، دانشگاه علوم پزشکی کرمان، مرکز تحقیقات فیزیولوژی

چکیده

کووید-19 کروناویروس نوظهور در ووهان چین است که با شیوع غیر معمول عفونت ریوی همراه بوده، اکنون به صورت همه‍گیری درآمده است. بر اساس ارتباطات تبارزایی و ساختارهای ژنتیکی، کووید-19 متعلق به جنس بتاکرونوویروس ها است. بتاکرونوویروس های انسانی (سارس- کرونا، مرس-کرونا، سارس-کرونا-2) شباهت زیادی با یکدیگر دارند، امّا در ساختارهای ژنتیکی و فنوتیپی تفاوت هائی وجود دارد در بیماری زائی آنها مؤثرند. کووید-19 RNA تک رشته ای مثبت (رشتۀ sense) دارد که به نوکلئوپروتینی متصل است و در کپسید حاوی پروتئین ماتریکس قرار دارد. یک کروناویروس معمول، حداقل شش چارچوب خوانش باز (Open reading frame; ORFs) در ژنگان خود دارد. تمام پروتئین­های ساختاری و کمکی از روی RNA های تک زنجیره کرونا ویروس ها ترجمه می شوند. چهار پروتئین ساختاری اصلی با ORF شماره 10 و 11 که یک سوم ژنگان را تشکیل می­دهند و نزدیک به انتهای 3’ قرار دارند رمزگذاری می­شوند. ساختار ژنتیکی و فنوتیپی کووید-19 در بیماری زائی آن اهمیت دارد. این مقاله ویژگی های مهم ژنتیکی و فنوتیپی کووید-19 را در مقایسه با دیگر بتاکروناویروس ها مشخص می‍کند.

کلیدواژه‌ها

Andersen, K.G., Rambaut, A., Lipkin, W.I., Holmes, E.C., and Garry, R.F. (2020). The proximal origin of SARS-CoV-2. Nat. Med. Published online March 17, 2020. 10.1038/s41591-020-0820-9.
CDC (2020). Coronavirus Disease 2019 (COVID-19). Centers for Disease Control and Prevention, https://www.cdc.gov/coronavirus/2019-ncov/hcp/clinical-guidance-management-patients.html.
Hoffmann, M., Kleine-Weber, H., Schroeder, S., Krüger, N., Herrler, T., Erichsen, S., Schiergens, T.S., Herrler, G., Wu, N.-H., Nitsche, A., et al. (2020). SARS-CoV-2 Cell Entry De-pends on ACE2 and TMPRSS2 and Is Blocked by a Clinically Proven Protease Inhibitor. Cell. Published online March 5, 2020. 10.1016/j.cell.2020.02.052.
Li, Q., Guan, X., Wu, P., Wang, X., Zhou, L., Tong, Y., Ren, R., Leung, K.S.M., Lau, E.H.Y., Wong, J.Y., et al. (2020). Early Transmission Dynamics in Wuhan, China, of Novel Corona-virus-Infected Pneumonia. N. Engl. J. Med. 382, 1199–1207.
McCreary, E.K., and Pogue, J.M. (2020). Coronavirus Disease 2019 Treatment: A Review of Early and Emerging Options. Open Forum Infect. Dis. 7, ofaa105.
Pang, J., Wang, M.X., Ang, I.Y.H., Tan, S.H.X., Lewis, R.F., Chen, J.I.-P., Gutierrez, R.A., Gwee, S.X.W., Chua, P.E.Y., Yang, Q., et al. (2020). Potential Rapid Diagnostics, Vaccine and Therapeutics for 2019 Novel Coronavirus (2019-nCoV): A Systematic Review. J. Clin. Med. 9, 623.
Prompetchara, E., Ketloy, C., and Palaga, T. (2020). Immune responses in COVID-19 and potential vaccines: Lessons learned from SARS and MERS epidemic. Asian Pac. J. Allergy Immunol. 38, 1–9.
Wölfel, R., Corman, V.M., Guggemos, W., Seilmaier, M., Zange, S., Müller, M.A., Niemeyer, D., Jones, T.C., Vollmar, P., Rothe, C., et al. (2020). Virological assessment of hospitalized patients with COVID-2019. Nature. 10.1038/s41586-020-2196-x.
Zhou, F., Yu, T., Du, R., Fan, G., Liu, Y., Liu, Z., Xiang, J., Wang, Y., Song, B., Gu, X., et al. (2020a). Clinical course and risk factors for mortality of adult inpatients with COVID-19 in Wuhan, China: a retrospective cohort study. The Lancet 395, 1054–1062.
Zhou, P., Yang, X.-L., Wang, X.-G., Hu, B., Zhang, L., Zhang, W., Si, H.-R., Zhu, Y., Li, B., Huang, C.-L., et al. (2020b). A pneumonia outbreak associated with a new coronavirus of probable bat origin. Nature 579, 270–273. 
دوره 4، شماره 7 - شماره پیاپی 7
اردیبهشت 1399
صفحه 214-219
  • تاریخ دریافت: 22 بهمن 1398
  • تاریخ بازنگری: 10 تیر 1399
  • تاریخ پذیرش: 10 تیر 1399